Straight Walk® 未知ゲノム領域解析
Straight Walk®の特長
- Straight Walk® Kit(旧Right Walk® kit) を用いた未知領域のクローニングおよびシークエンスを受託いたします。
- ヒトの10倍のゲノムサイズをもつサンプルから未知領域をクローニングできます。
- 制限酵素処理をした後にアダプターを結合させ、既知配列に設計したプライマーでPCRを行います。プライマーにはNotⅠの切断配列が含まれているため既知プライマーに適切な制限酵素部位を付加することにより、様々なベクターにサブクローニングが可能です。
- 解析は制限酵素を最大で9種類を用いて行います。
関連特許
新規のオリゴヌクレオチドアダプター及びプライマー (特許4603798号)
Straight Walk®法の原理および作業の流れ
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- 制限酵素処理
- 最大9種類の制限酵素サイトの位置により使用できる制限酵素の数が違います。
- 1塩基伸長
- アダプター結合
- 1回目のPCR
- 2回目のPCR (nested RCR)
- 理論上、最大5kb程度の増幅が可能ですが、得られるPCR断片は制限酵素サイトの位置で左右されるため、大きさは様々です。
- クローニング
- ⑤で得られたPCR断片のうち、最も大きいものをクローニングします。
- シークエンス
Straight Walk®Kit (Right Walk®Kit)の参考文献
- Straight Walk:A modified method of ligation-mediated genome walking for plant species with large genomes
Analytical Biochemistry 388(2009) 158-160:
Tokuji Tsuchiya, Nanako Kameya, Ikuo Nakamura - De novo DNA methylation of the 35S enhancer revealed by high-resolution methylation analysis of an entire T-DNA segment in transgenic gentian
Plant Biotechnology 28,223-230(2011)
Satoshi Yamasaki, Masayuki Oda, Nozomu Koizumi, Kazuhiko Mitsukuri, Masafumi Johkan, Takashi Nakatsuka, Masahiro Nishihara, Kei-ichiro Mishiba - Novel Isoforms of Heat Shock Transcription Factor 1 Are Induced by Hypoxia in the Pacific Oyster Crassostrea gigas
J.Exp.Zool. 315:394-407,2011
SHINYA KAWABE AND YOSHIHIRO YOKOYAMA
Straight Walk®受託の価格・納期
価格 | 納期 | |
---|---|---|
片側クローニング※1 | ¥90,000 | 約3週間~ |
両側クローニング※2 | ¥160,000 | 約4週間~ |
- 既知配列の5'末端上流または3'末端下流どちらか一方の未知配列決定
- 既知配列の5'末端上流と3'末端下流の未知配列決定
ご依頼・サンプル送付方法
- 当ページ下部からオーダーフォームをダウンロードしてご依頼内容をご記入ください。
- オーダーフォームにご記入後、E-mailに添付して送信してください。また、以下の情報をテキスト形式で一緒に送信してください。
- 既知の配列情報
- 以下の送付物を梱包して弊社ラボまでお送りください。
- プリントアウトしたオーダーフォーム
- ゲノムDNA 2μg以上※冷凍でお送り下さい。
送付先
株式会社ベックス
〒173-0004 東京都板橋区板橋2-61-15 4F
: 03-5375-1071
納品内容
- 未知配列
- 作業報告書
Straight Walk®受託のご注意
- お客様と協議の上、作業を中止せざるを得なくなった場合は実費料金が発生いたします。
- お送りいただいたサンプルは機密保持に基づき厳重に処分いたします。
- サンプルをお送りいただく際、送料はお客様ご負担となります。
ご注文
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